зарегистрируйтесь или войдите чтобы посмотреть ссылкуAm J Gastroenterol заранее онлайн публикации 9 октября 2012 года; DOI: 10.1038/ajg.2012.335
Микробиоты De-Novo детской IBD: Повышение Faecalibacterium Prausnitzii и уменьшенный бактериального разнообразия в Крона, но не в язвенный колит
Открыто
Ричард Хансен MBChB1, 2, Richard Russell K MBChB, PhD3, Кэролайн Reiff PhD4, Петра Louis PhD5, Фрида McIntosh BSc5, Сьюзен H Berry1, Indrani Mukhopadhya PhD1, W Майкл Биссет MBChB, MD6, Энди R Barclay MBChB, MD3, Джон Бишоп MBChB3 Диана M Флинн MBChB, PhD3, Paraic McGrogan MBChB3, Sabarinathan Loganathan MBChB6, Гамаль Махди MBChB6, Гарри Флинт J PhD5, Emad M-эль-Омар MBChB, MD1 и Джорджина L Держа PhD1
1Gastrointestinal Research Group, отдел прикладной медицины, Университет Абердина, Абердин, Великобритания
2Child здравоохранения, больницы Royal Aberdeen детей, Университет Абердина, Абердин, Великобритания
3Department детской гастроэнтерологии, Королевской больницы для больных детей, Глазго, Великобритания
4Max Planck Institute, Кельн, Германия
5Gut программа здравоохранения, Rowett институт, Университет Абердина, Абердин, Великобритания
6Department детской гастроэнтерологии больницы Royal Aberdeen детей, Абердин, Великобритания
Корреспонденция: Джорджина Л. Hold, кандидат медицинских наук, желудочно-кишечного тракта Research Group, отдел прикладной медицины, Университет Абердина, Foresterhill, Aberdeen AB25 2ZD, Великобритания. Электронная почта: g.l.hold @ abdn.ac.uk
Поступила в редакцию 7 мая 2012 г. Принята 13 августа 2012
Предварительная онлайн-публикации 9 октября 2012
К началу страницы
Абстрактный
ЦЕЛИ:
Желудочно-кишечные микробиоты считается важным при воспалительных заболеваниях кишечника (IBD) патогенез. Открытия от установленных когорты заболевание сообщают уменьшить бактериальную разнообразия, изменения в составе бактериальных и защитную роль для Faecalibacterium prausnitzii при болезни Крона (БК). Большинство исследований на сегодняшний день, однако потенциально путают эффект от лечения и зависимость от установленных, а не де-Ново болезни.
МЕТОДЫ:
Микробная изменения в диагнозе были рассмотрены biopsying слизистой оболочки толстой кишки из 37 детей: 25 с новым представлением, необработанные IBD с активным колитом (13 CD и 12 неспецифический язвенный колит (UC)), и 12 педиатрических управления с макроскопически и микроскопически нормальных толстой кишки. Мы использовали двойной методологический подход с пиросеквенирования (порог> 10000 прочтений) и подтверждающего ПЦР в реальном времени (RT-PCR).
РЕЗУЛЬТАТЫ:
Порог пиросеквенирования выходе был получен на 34 субъектов (11 CD, 11 UC, 12 управлений). Никаких существенных изменений были отмечены на уровне филы среди Bacteroidetes, Firmicutes, или протеобактерий. Значительное снижение бактериальной α-разнообразие было отмечено в CD сравнению управления тремя способами (Шеннона, Симпсона, и филогенетического разнообразия), но не в UC сравнению с контролем. Увеличение Faecalibacterium наблюдается в CD сравнению с контрольной группой по пиросеквенирования (в среднем 16,7% против 9,1% операций чтения, P = 0,02) и воспроизведены конкретные F. prausnitzii RT-PCR (36,0% против 19,0% от общего числа бактерий, P = 0,02). Нет конкретных заболеваний кластеризации было видно на анализе главных компонент.
ВЫВОДЫ:
Наши результаты предлагают комплексное обследование IBD слизистой микрофлоры при постановке диагноза, не зависит от терапевтической вмешивающихся факторов или изменение с течением времени. Наши результаты бросают вызов нынешней модели защитную роль для F. prausnitzii в CD, предлагая более динамичную роль для организма, чем это описано выше.
К началу страницы
ВВЕДЕНИЕ
Воспалительные заболевания кишечника (IBD) объединяет группу заболеваний, характеризующихся хроническим воспаление кишечника с основными фенотипов быть болезнью Крона (БК) и неспецифический язвенный колит (UC). Заболеваемость IBD растет, особенно у детей (1,2,3). Генетические открытия причастности внутриклеточных бактериальных признания (NOD2) и механизмы внутриклеточной бактериальной обработки, такие как аутофагия (4,5). Важность принимающей врожденного иммунного ответа на бактерии выделены эти открытия привели к возобновлению интереса к кишечной микрофлоры в IBD. Микрофлора выполняет важную роль в иммунологических развития, защиты от патогенов, производство экзогенных ферментов, и спасение калорийность питания (6,7). Исследования микрофлоры IBD показали изменения в его составе, которые теперь являются частью парадигмы патогенезе заболевания. Они включают в себя увеличение бактериального числа, снижение бактериального разнообразия, увеличения типам Proteobacteria и Bacteroidetes, и сокращение Firmicutes (8,9,10,11). Опубликованные данные на сегодняшний день в значительной степени опирался на оппортунистические исследования пациентов с выявленными заболеваниями, обеспечение микробные моментальный снимок состояния хронического заболевания в различные моменты времени после постановки диагноза. Существенным недостатком такого подхода, однако, что основные вмешивающихся факторов активного лечения и болезни хроническое сделать это невозможно интерпретировать события, последовавшие с начала заболевания (12). Допрос фекальной микробиоты во многих исследованиях также представляет трудности, так как слизистые оболочки и фекальные бактериальные экосистемы признаны различными в области здравоохранения, но мало известный в болезненных состояниях (13,14).
Детская IBD предлагает возможность исследовать эти проблемы, так как дети относительно свободны от существенных дополнительных сопутствующих заболеваний и, как правило, лечение наивных на момент постановки диагноза IBD. По этим причинам, мы создали "Бактерии в Воспалительные заболевания кишечника в шотландских детей, которые проходят исследование до лечения" (печенье) исследования.
К началу страницы
МЕТОДЫ
Пациент найма, биопсия сбор и обработку
Пациенты были привлечены к изучению BISCUIT от обычных списков колоноскопии в каждой из трех детских центров (больницы Royal Aberdeen детей, Абердин, Королевского госпиталя для больных детей, Глазго и Ninewells больницы, Dundee). Первоначальный подход с изучением информации осуществляется либо по почте до начала приема или в день приема, минимум 12 часов до начала процедуры. Пациенты под следствием в педиатрических центров подошли, если лечащий врач считает возможным, что они будут обнаружены либо IBD или нормальный толстой кишки при колоноскопии. Пациенты были исключены, если они получили системные антибиотики или стероиды в 3-х месяцев до их колоноскопии или иммуносупрессии в любое время, или если бы они имели предыдущий диагноз IBD. Все пациенты были исследованы как в Порту критериям, то диагноз и phenotyped со ссылкой на стандартных критериев (15,16,17,18).
За 3 года исследований набраны 100 детей проходит колоноскопия по всей Шотландии на две категории: те, с вероятностью IBD, в первую презентацию, с макроскопической толстой воспаления (п = 45) и тех, кто проходит колоноскопия, который впоследствии был нормальный толстой кишки макроскопически (п = 55) . Окончательная когорта IBD составляли 44 подтвердили IBD предметы (29 CD, 13 UC, и 2 IBD, типа несекретных). Остальные "скорее всего IBD» (воспаление толстой кишки) испытуемый должен был мягким, неспецифические хронические воспаления в их дистального отдела толстой кишки на гистопатологии. Это было недостаточным, чтобы оправдать официального диагноза IBD.
РЕКЛАМА
Биопсии были взяты из одного сайта, от дистального отдела толстой кишки в контрольной группе (прямой кишки / сигмовидной кишки), или от наиболее дистального воспаленной сайта в IBD. В целом, 2-3 биопсий были собраны с использованием стандартных эндоскопических щипцов. Биопсия были собраны в стерильный 1,5 мл Eppendorf контейнер и поместить сразу на лед перед передачей хранения до -80 ° C.
Для изучения бактериального разнообразия, 37 пациентов были выявлены для дальнейшего анализа (табл. 1; Дополнительный табл. 1). Двенадцать UC были включены, все с дистальной толстой воспаления. Тринадцать пациентов CD были определены с гранулематозные изменения в их множестве биопсии, твердо поддерживали их диагностики, и дистальной толстой воспаления в соответствии с компакт-диска (и, следовательно, дистальной толстой биопсия), чтобы соответствовать толстой сайта с контролем и UC когорт. Двенадцать контроля были выбраны в качестве наиболее представительной из "нормальных", имеющие как макроскопически и микроскопически нормальных толстой кишки, соответствуют как можно ближе по возрасту и полу в IBD групп. Ни один из элементов управления пошли на развитие IBD со средним временем, так как эндоскопия 23 месяцев (минимум 7 месяцев).
.................................................
"В частности, рифаксимина было показано, модулирует толстой микробиоты пациентов с болезнью Крона при увеличении концентрации бифидобактерий и Faecalibacterium prausnitzii [18]."
и немного из 2008
ром 2008 года:
"Пероральное введение в прямом эфире F. prausnitzii или его супернатант заметно снижается тяжесть TNBS колит и, как правило, чтобы исправить дисбактериоз, связанный с TNBS колите, как продемонстрировано в реальном времени количественный ПЦР (КПЦР) анализа. F. prausnitzii обладает противовоспалительными эффекты на клеточном и моделей TNBS колит, отчасти из-за выделяются метаболиты способны блокировать NF-kB активации и IL-8 производства. Эти результаты показывают, что использование уравновешивающих дисбактериоз F. prausnitzii качестве пробиотика является перспективной стратегией в CD лечения ".
Автор
Тема: Рифаксимин,он же Альфа Нормикс (Прочитано 274810 раз)